Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Polr1aO35134 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Polr1aO35134 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Polr1aO35134 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.84■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC32.82■■■□□ 2.85
Polr1aO35134 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Polr1aO35134 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms