Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArxO35085 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArxO35085 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ArxO35085 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArxO35085 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArxO35085 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArxO35085 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArxO35085 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArxO35085 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArxO35085 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArxO35085 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ArxO35085 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ArxO35085 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArxO35085 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArxO35085 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArxO35085 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArxO35085 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArxO35085 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ArxO35085 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArxO35085 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArxO35085 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArxO35085 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArxO35085 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArxO35085 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArxO35085 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArxO35085 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ArxO35085 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArxO35085 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArxO35085 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArxO35085 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArxO35085 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ArxO35085 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ArxO35085 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ArxO35085 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ArxO35085 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ArxO35085 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ArxO35085 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ArxO35085 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ArxO35085 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArxO35085 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArxO35085 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArxO35085 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ArxO35085 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ArxO35085 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ArxO35085 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ArxO35085 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ArxO35085 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ArxO35085 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ArxO35085 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ArxO35085 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ArxO35085 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ArxO35085 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ArxO35085 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ArxO35085 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ArxO35085 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ArxO35085 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ArxO35085 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms