Protein–RNA interactions for Protein: O08919

Numbl, Numb-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NumblO08919 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NumblO08919 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NumblO08919 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NumblO08919 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NumblO08919 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NumblO08919 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NumblO08919 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NumblO08919 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NumblO08919 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NumblO08919 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NumblO08919 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NumblO08919 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NumblO08919 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NumblO08919 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NumblO08919 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NumblO08919 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NumblO08919 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NumblO08919 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NumblO08919 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NumblO08919 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NumblO08919 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NumblO08919 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NumblO08919 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NumblO08919 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NumblO08919 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NumblO08919 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NumblO08919 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NumblO08919 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NumblO08919 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NumblO08919 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
NumblO08919 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NumblO08919 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NumblO08919 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NumblO08919 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NumblO08919 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NumblO08919 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NumblO08919 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NumblO08919 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NumblO08919 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NumblO08919 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NumblO08919 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NumblO08919 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NumblO08919 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NumblO08919 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NumblO08919 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NumblO08919 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NumblO08919 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
NumblO08919 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NumblO08919 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
NumblO08919 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NumblO08919 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NumblO08919 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NumblO08919 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NumblO08919 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NumblO08919 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NumblO08919 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NumblO08919 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NumblO08919 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NumblO08919 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NumblO08919 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NumblO08919 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NumblO08919 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NumblO08919 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NumblO08919 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms