Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Dctn1O08788 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dctn1O08788 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dctn1O08788 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms