Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20939L7N243 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm20939L7N243 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm20939L7N243 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms