Protein–RNA interactions for Protein: L7MU04

H2al1o, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1oL7MU04 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2al1oL7MU04 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2al1oL7MU04 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms