Protein–RNA interactions for Protein: J3QPR6

Rfpl4b, MCG1377, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfpl4bJ3QPR6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rfpl4bJ3QPR6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rfpl4bJ3QPR6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rfpl4bJ3QPR6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms