Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Gm5814J3QP80 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5814J3QP80 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Gm5814J3QP80 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm5814J3QP80 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm5814J3QP80 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms