Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
AK157302I3ITR1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
AK157302I3ITR1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
AK157302I3ITR1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AK157302I3ITR1 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AK157302I3ITR1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AK157302I3ITR1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AK157302I3ITR1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
AK157302I3ITR1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms