Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r67G5E8C1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vmn1r67G5E8C1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r67G5E8C1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms