Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Pcf11G3X9Z4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Pcf11G3X9Z4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Pcf11G3X9Z4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Pcf11G3X9Z4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Pcf11G3X9Z4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms