Protein–RNA interactions for Protein: G3UXE9

Gm8909, Predicted gene 8909, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8909G3UXE9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8909G3UXE9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8909G3UXE9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8909G3UXE9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gm8909G3UXE9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms