Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nkx1-1G3UXB3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nkx1-1G3UXB3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nkx1-1G3UXB3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms