Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm20517G3UVU6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm20517G3UVU6 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms