Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm6482F6YHC1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm6482F6YHC1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms