Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Crocc2F6XLV1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Crocc2F6XLV1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Crocc2F6XLV1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Crocc2F6XLV1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms