Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Gm17555F6U8B9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm17555F6U8B9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm17555F6U8B9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms