Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm28305F6U473 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm28305F6U473 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms