Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Syngap1F6SEU4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syngap1F6SEU4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Syngap1F6SEU4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms