Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Urb2E9Q7L1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Urb2E9Q7L1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Urb2E9Q7L1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Urb2E9Q7L1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Urb2E9Q7L1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms