Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp31E9Q6Y8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp31E9Q6Y8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Usp31E9Q6Y8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms