Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc85cE9Q6B2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc85cE9Q6B2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc85cE9Q6B2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc85cE9Q6B2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms