Protein–RNA interactions for Protein: E9Q512

Trip11, Thyroid hormone receptor interactor 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,976 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip11E9Q512 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trip11E9Q512 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trip11E9Q512 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trip11E9Q512 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trip11E9Q512 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms