Protein–RNA interactions for Protein: E9Q271

Wdr17, WD repeat domain 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr17E9Q271 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Wdr17E9Q271 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Wdr17E9Q271 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Wdr17E9Q271 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Wdr17E9Q271 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Wdr17E9Q271 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms