Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
Fndc1E9Q043 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Fndc1E9Q043 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Fndc1E9Q043 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Fndc1E9Q043 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms