Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ddx60E9PZQ1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ddx60E9PZQ1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ddx60E9PZQ1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ddx60E9PZQ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
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