Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Brd1E9PZ26 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Brd1E9PZ26 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Brd1E9PZ26 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms