Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Rsf1E9PWW9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC35.88■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC35.87■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
Rsf1E9PWW9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC35.82■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC35.76■■■■□ 3.32
Rsf1E9PWW9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Rsf1E9PWW9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms