Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc144bE9PVZ3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc144bE9PVZ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc144bE9PVZ3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms