Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB5

Ttc17, Tetratricopeptide repeat protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc17E9PVB5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc17E9PVB5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ttc17E9PVB5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ttc17E9PVB5 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms