Protein–RNA interactions for Protein: E9PUW8

Ccdc24, Coiled-coil domain-containing 24, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc24E9PUW8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc24E9PUW8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc24E9PUW8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc24E9PUW8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc24E9PUW8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc24E9PUW8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ccdc24E9PUW8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc24E9PUW8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc24E9PUW8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc24E9PUW8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ccdc24E9PUW8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc24E9PUW8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms