Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Syde2E9PUP1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Syde2E9PUP1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Syde2E9PUP1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms