Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Klhl3E0CZ16 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Klhl3E0CZ16 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Klhl3E0CZ16 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms