Protein–RNA interactions for Protein: D3Z741

4930444G20Rik, RIKEN cDNA 4930444G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444G20RikD3Z741 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
4930444G20RikD3Z741 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
4930444G20RikD3Z741 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930444G20RikD3Z741 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms