Protein–RNA interactions for Protein: D3Z236

Gm3676, Predicted gene 3676, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3676D3Z236 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gm3676D3Z236 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3676D3Z236 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.1 ms