Protein–RNA interactions for Protein: D3YY23

Lonrf1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, mousemouse

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Length 762 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf1D3YY23 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Lonrf1D3YY23 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Lonrf1D3YY23 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lonrf1D3YY23 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms