Protein–RNA interactions for Protein: D3YX25

Gm7257, Predicted gene 7257, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7257D3YX25 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm7257D3YX25 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm7257D3YX25 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms