Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Trim30cD3YVI9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Trim30cD3YVI9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim30cD3YVI9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.7 ms