Protein–RNA interactions for Protein: B5KM66

Syce3, Synaptonemal complex central element protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce3B5KM66 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Syce3B5KM66 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syce3B5KM66 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syce3B5KM66 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms