Protein–RNA interactions for Protein: B2RXS4

Plxnb2, Plexin-B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb2B2RXS4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Plxnb2B2RXS4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Plxnb2B2RXS4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Plxnb2B2RXS4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms