Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cfap58B2RW38 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cfap58B2RW38 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cfap58B2RW38 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms