Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Slc22a28B2RT89 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Slc22a28B2RT89 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Slc22a28B2RT89 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms