Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrklB2RRL2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrklB2RRL2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrklB2RRL2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrklB2RRL2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrklB2RRL2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
JrklB2RRL2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
JrklB2RRL2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JrklB2RRL2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrklB2RRL2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.29■■□□□ 1
JrklB2RRL2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
JrklB2RRL2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms