Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB3

Gm438, MCG65768, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm438B1ASB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm438B1ASB3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm438B1ASB3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm438B1ASB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms