Protein–RNA interactions for Protein: A9Z055

H2al2b, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al2bA9Z055 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
H2al2bA9Z055 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H2al2bA9Z055 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2al2bA9Z055 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms