Protein–RNA interactions for Protein: A2RTT5

Vmn1r232, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r232A2RTT5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r232A2RTT5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vmn1r232A2RTT5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms