Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htra4A2RT60 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htra4A2RT60 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htra4A2RT60 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Htra4A2RT60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Htra4A2RT60 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Htra4A2RT60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Htra4A2RT60 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Htra4A2RT60 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms