Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H2al1jA2BFR3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
H2al1jA2BFR3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms