Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Samt1A2BED8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Samt1A2BED8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Samt1A2BED8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms