Protein–RNA interactions for Protein: A2ATD1

Ism1, Isthmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ism1A2ATD1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ism1A2ATD1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ism1A2ATD1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ism1A2ATD1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms